שְׁאֵלָה:
קודים גנטיים חלופיים באורגניזמים שרצפו לאחרונה
Daniel Standage
2011-12-22 11:35:08 UTC
view on stackexchange narkive permalink

וריאציות של הקוד הגנטי הסטנדרטי הן די נדירות, אך מכיוון שהעלות של רצף הגנום עם תפוקה גבוהה ממשיכה לרדת, קיימת אפשרות גדולה יותר לגלות חריגים נוספים. עם זאת, יש דגש ברור בפרויקטים של הגנום על רצף נוקלאוטידים (גנום ותעתיק), עם הרבה פחות (אם בכלל) מאמץ שהושקע בעבודה של פרוטאומיקה (תקנו אותי אם אני טועה שם).

שאלתך מעורפלת מאוד. האם אתה יכול להיות יותר ספציפי ו / או יותר קונקרטי? יש תריסר טכנולוגיות רצף ועוד יותר וריאציות לקוד הגנטי.
אולי העמימות נובעת מכך שאני לא יודע למה לצפות אם הייתי מנסה להעלות הערה על הגנום של אורגניזם המשתמש בקוד גנטי חלופי. השאלה הבסיסית שלי היא: האם בכלל אוכל לספר? האם זה לא ברור מהשאלה המקורית?
אני חושב שזו שאלה ברורה.
שְׁלוֹשָׁה תשובות:
#1
+6
chkuo
2012-01-06 00:34:08 UTC
view on stackexchange narkive permalink

אם האורגניזם משתמש בקוד חלופי, רצפי החלבון החזויים יכללו תמיד את אותו סוג של שגיאות החלפת חומצות אמינו. דפוס זה אמור להתברר כשמשווים את החלבונים לאורגניזמים אחרים. למעשה, הקוד האלטרנטיבי הנפוץ ביותר משתמש ב- UGA לטריפטופן במקום התחנה הרגילה. אם אתה עושה את הטעות בשימוש בקוד הסטנדרטי לגנומים אלה, הגנים החזויים היו מקוטעים מאוד ולכן כמעט בלתי אפשרי שלא להבחין בכך.

#2
+3
KAM
2011-12-22 19:45:44 UTC
view on stackexchange narkive permalink

נכון שאתה קצת מודאג, במיוחד עם הגנום המיטוכונדריאלי (שם קודים גנטיים לא סטנדרטיים נפוצים יותר). בנוסף לשימוש בקודים שאינם סטנדרטיים, עליך לשקול גם עריכת RNA (קודונים שהוחלפו או נוקלאוטידים שנמחקו / הוכנסו לשינוי מסגרות קריאה) וחומצות אמינו מיוחדות (למשל, סלנוציסטאין). בסך הכל, הדגש על רצף DNA כדי להסיק את מבנה החלבון הוא בטוח ברוב המקרים, אך אל תתפלאו מהבדלים (בגנים מסוימים או באורגניזמים שלמים).

#3
+2
Thomas Ingalls
2011-12-22 13:09:47 UTC
view on stackexchange narkive permalink

התשובה הקצרה היא כן, אתה עלול בסופו של דבר לשגיאות רבות. ראה כאן לפרטים נוספים:

NCBI: "הקודים הגנטיים"



שאלה ותשובה זו תורגמה אוטומטית מהשפה האנגלית.התוכן המקורי זמין ב- stackexchange, ואנו מודים לו על רישיון cc by-sa 3.0 עליו הוא מופץ.
Loading...