שְׁאֵלָה:
מדוע היה כל כך קשה לפענח את גנום התירס?
Gabriel Fair
2011-12-24 11:52:25 UTC
view on stackexchange narkive permalink

המורים שלי שגדלו אמרו לי שאי אפשר לפענח את הגנום של התירס. אבל עדיין זה נעשה.

מדוע פענוח הגנום היה כה משמעותי, ומה הקשה עליו כל כך?

אם אני זוכר נכון: זה ענק ויש בו הרבה אזורים שחוזרים על עצמם. קשה מאוד לרצף בצורה מדויקת של חזרות * דה נובו * בנאמנות גבוהה.
שתיים תשובות:
#1
+23
Damian Kao
2011-12-24 12:48:36 UTC
view on stackexchange narkive permalink

התשובה הקצרה היא שגנום התירס הוא גדול ויש בו כמות עצומה של אירועי כפילות. בסביבות 80% מהגנום חוזרים על עצמם. קשה להרכיב גנומים עם כמות גדולה של כפילויות מכיוון שטכנולוגיית הרצף שלנו, במקרה הטוב, במקרה הטוב יכולה לתת ~ 500 זוגות בסיס. להבין את סדר האזורים המשוכפלים מסתמך על רצפי פיגומים או הרכבה השוואתית לגנום האורז.

#2
+9
chkuo
2012-01-06 00:13:34 UTC
view on stackexchange narkive permalink

מדוע פענוח הגנום היה כה משמעותי? מכיוון שפענוח הגנום נותן לנו תמונה מלאה של ההרכב הגנטי של אורגניזם.

מה הקשה על כך ? הרצפים החוזרים על עצמם כפי שהוזכר על ידי אנשים אחרים הם בעיה עיקרית. הדמיה אתה מנסה להשלים פאזל גדול עם מיליוני חלקים. כל קטע מייצג רצף שקוראים לנו מהניסוי. אם יש רצפים חוזרים בגנום, בעצם החלקים המייצגים אזורים אלה ייראו דומים מאוד (או אפילו זהים לחלוטין). אין ספק שהדבר יקשה מאוד על סיום הפאזל. כדי לתת קנה מידה, הגנום של התירס הוא ~ 2.3 מיליארד זוגות בסיס וכל רצף שנקרא הוא <1,000 זוגות בסיס.



שאלה ותשובה זו תורגמה אוטומטית מהשפה האנגלית.התוכן המקורי זמין ב- stackexchange, ואנו מודים לו על רישיון cc by-sa 3.0 עליו הוא מופץ.
Loading...