שְׁאֵלָה:
האם יש חיידק שהפך לנגיף?
Raphael Augusto
2020-05-06 04:20:28 UTC
view on stackexchange narkive permalink

האם ייתכן שנגיף יהיה צאצא של חיידק שלא עבר העברת גנים אופקית?

איך אני חושב שזה יכול לקרות:

ניסוי הקשור לשאלה זו, הוכח כי נגיפים יכולים לאבד כמה גנים בסביבה שבה הוא יכול למצוא באופן טבעי את החלבון שקשור לגנים ההם. לפיכך, יש סיכוי שמין זה יהפוך כל כך פשוט, שבסופו של דבר יהפוך לנגיף.
הקושי המהותי בתיאוריה זו הוא שהחיידק יצטרך איכשהו ללמוד להכין חלבונים מרובים בכדי לכמוס ולהעביר את החומר הגנטי. זו בעיה קלאסית של עוף או ביצה לאבולוציה: כדי לחזור ולפתח את המנגנון, המנגנון חייב להתקיים. זו בעיה גלויה לאבולוציה, ולכן אני לא רוצה לנטרל את התיאוריה שלך רק בהיבט זה. אבל - עליכם לממש רעיון זה דורש ידע הרבה מחוץ למה שאנחנו מבינים היטב באבולוציה. האם זה אפשרי? אף אחד לא יודע. האם זה מתקבל על הדעת? כן, אבל קשה מאוד
המיטוכונדריה והכלורופלסטים מקורם בפרוקריוטים אנדוסימביוטיים שכבר אינם יכולים להתרבות מחוץ למארח איקריוטי, ובמיליארדי שנים הם לא פשטו בשום מקום קרוב כל כך. כמו בנקודת @BAMF4bacon's, זהו קושי לא קטלני אך משמעותי.
האם אתה יכול להיות הרבה יותר מציאותי, רפאל? החיידק שלך אכן מקבל את כל המשאבים להתרבות, ללא שינויים בסביבה. אם הוא מאבד גן (חשוב) הוא יכול להשיג (זה?) מהסביבה? זה יכול להיות יתרון אבולוציוני; זה יכול להיות יעיל יותר בהעתקה? ואז, איך הניסוי שראיתם עבר מחיידקים לכל דבר שקשור לנגיפים? אולי וירוסים יכולים לאבד גנים כאשר הם מוצאים חלבונים בסביבה ואיך זה משנה חיידקים לנגיפים? האם התזה שלכם היא פשוט ש"יש סיכוי "או מה ?
שתיים תשובות:
Alex Reynolds
2020-05-06 05:00:11 UTC
view on stackexchange narkive permalink

באתר וירולוגיה זה יש פוסט אודות מאמר לשנת 2017 על פלסמידים עם קרום-ברק שפועלים בדרכים שתורתם מקדימים ל כיצד פועלים וירוסים:

סביר להניח כי שלפוחיות הממברנה המכילות פלסמיד הם מבשרי מה שאנחנו מכירים כיום כחלקיקי נגיף. חושבים כי נגיפים מקורם באלמנטים גנטיים אנוכיים כמו פלסמידים וטרנספוזונים כאשר חומצות גרעין אלו רכשו חלבונים מבניים (בתמונה; אשראי תמונה). ניתוחים פילוגנטיים של החלבונים המבניים של נגיפים רבים עטופים וערומים מראים כי מקורם ככל הנראה מחלבוני תאים בהזדמנויות מרובות ( קישור לנייר).

נראה כי פלסמיד ארכיאאלי עטוף בקרום. בדרך להיות נגיף, בהמתנה לרכישת חלבונים מבניים ויראליים.

למרות שפלסמידים אינם נגיפים ואינם חיידקים, חיידקים מארחים פלסמידים, ופלסמידים מוסיפים בעקיפין לגנטית. חיבור של חיידקים. ביטוי של גנים פלסמידים יכול לעזור לחיידקים לשרוד בסביבות עוינות או קיצוניות, והם מתרבים יחד עם כרומוזומי חיידקים. באמצעות הקישור לויקיפדיה:

בניגוד לנגיפים, המקיפים את החומר הגנטי שלהם במעטה חלבון מגן המכונה קפסיד, פלסמידים הם DNA "עירום" ואינם מקודדים גנים הנחוצים לכיסוי החומר הגנטי עבור העברה למארח חדש; עם זאת, סוגים מסוימים של פלסמידים מקודדים את הפילוס ה"מין "המצומד הדרוש להעברה משלהם.

Willk
2020-05-06 08:14:05 UTC
view on stackexchange narkive permalink

ישנם וירוסים ענקיים שיש אנשים שחושבים שהם חיידקים מנווונים.

https://en.wikipedia.org/wiki/Mimivirus

Mimivirus מראה מאפיינים רבים אשר מציבים אותו בגבול בין חי לאי. הוא גדול כמו כמה מיני חיידקים, כגון Rickettsia conorii ו- Tropheryma whipplei, בעל גודל גנומי השווה לזה של מספר חיידקים, כולל אלו לעיל, וקודים למוצרים שלא נחשבו מקודדים על ידי וירוסים (כולל סוג של קולגן. [20]). בנוסף, לווירוס המימיבי יש גנים המקודדים לסינתזת נוקליאוטידים וחומצות אמינו, אשר אפילו לחלק מהחיידקים התוך תאיים הקטנים המחויבים. עם זאת, חסר להם כל גנים לחלבונים ריבוזומליים, מה שהופך את המיווירוס לתלוי בתא מארח לצורך תרגום חלבונים ומטבוליזם אנרגטי. Block> דברים שונים שלא היו זקוקים להם באורח חייהם הטפילי, וכתוצאה מכך משהו שמתאים להגדרת הנגיף. חיידקים טפיליים אחרים (כמו אלה שהוזכרו במאמר) איבדו רכיבים מיותרים אחרים אך נשמרו כך שהם עדיין מתאימים להגדרת תא.

האם תוכל להתייחס לטענתך כי "יש אנשים שחושבים (Mimivirus) יכולים להיות חיידקים מנווונים"? רצוי שמישהו עם המומחיות הרלוונטית? דף ויקיפדיה אינו כולל נקודת ספקולציה זו ונראה שהוא שקרי.
הנגיפים הענקיים כמו מיני-וירוס עשויים להיות אורגניזמים חיים חופשיים מנווונים, אולי חיידק, אך סביר יותר להניח שהוא ארכיאון או אוקריוט (בהתבסס על מספר הגנים ההומולוגיים). מאמר אחד שתוכלו להפנות אליו הוא Abrahão [2014] doi: 10.1186 / 1743-422X-11-120
@BryanKrause - האמירה שזה נראה שגוי פירושה שלא בדקת כלל את קריאת הוויקיפדיה בעבר, ואני חושד שאתה מסוגל. אבל אם לא, הנה הקישור ללהיט הראשון של מימיוירוס בגוגל: https://www.nature.com/articles/nrmicro.2016.197. הנה טקסט מאותו קישור: יתר על כן, קיימת מחלוקת בשאלה האם הגנום הגדול של נגיפי ענק הוא תוצאה של נגיפים קטנים יותר שרוכשים גנים או של גנום שמוצאו הסלולרי מסתגל לברוח מגרעין התא 2,9,10,11,12 , 13.
@Willk עליכם לספק תשובה מלאה, לא עלי לחקור את השאלה כולה עבורכם. זה גם לא מקובל (ואני חושב שזה לא הגון אקדמי) לצטט מקור לטענה שלא טוענת את הטענה הזו - זה גורם להיראות כאילו יש לך תמיכה שאין לך. עד כה ציטטת רק את ויקיפדיה שאינה מעלה את הטענה הזו. אנא ערוך ציטוטים מתאימים לתשובתך לטענות שאתה מעלה במקום להעלות אותן בתגובות שכן ההערות הן ארעיות.
@BryanKrause אני מסכים שהוא צריך לצטט מקור, אבל האם אכפת לך לצטט מקור לטענתך שטענתו "סביר שקר"? ניסיתי מחקר ראשוני ולא ממש מצליח למצוא הרבה כדי לגבות אף אחת מהנקודות ... יותר כמו הרבה "זה וירוס, ענק, וירוס עם המון רצפי גנים שאנחנו מבולבלים לגביו, וכמה קווי דמיון ל תאים> נגיפים אחרים ... אבל באמת אין לנו מושג "- 100% רק לדוג קריאה טובה כי מצאתי את זה מעניין;) (אבל זה אמור לשפר את התשובה)
@TCooper דף ויקיפדיה כולל הצהרות כמו "שושלתו ישנה מאוד ויכולה להופיע לפני אורגניזמים תאיים" ו"הוצע כי Mimivirus וסוגים דומים הם שרידים ל"תחום רביעי "של החיים, ושוירוס ענק אחר עשוי מייצגים תחומים עתיקים אחרים "וכן להיות חלק מ https://en.wikipedia.org/wiki/Nucleocytoviricota שקשורים גנטית, כך שאחד מהם נגזר מחיידק מכולם. ההצהרה שלי לגבי "עלול להיות שקרי" התבססה בעיקר על המקור של OP עצמה, החל באומר דבר וכלה בסתירה
אני מאוד סקפטי כשאני רואה אנשים שמשתמשים בציטוטים כתמיכה בטענות שהם טוענים כאשר ציטוטים ממש לא מספקים תמיכה כלשהי.
מחדש "זה תלוי בך": אני די בטוח ששיתוף פעולה הוא יותר בונה, ותשובות יכולות להיות ערוכות על ידי אחרים. נראה שהשיחה הזו ירדה מהפסים ...)


שאלה ותשובה זו תורגמה אוטומטית מהשפה האנגלית.התוכן המקורי זמין ב- stackexchange, ואנו מודים לו על רישיון cc by-sa 4.0 עליו הוא מופץ.
Loading...